L'exposition permanente «Archéologie Suisse» occupe le premier étage de la nouvelle aile conçue par les architectes Christ Gantenbein. En guise d’introduction, les découvertes en provenance des régions montagneuses, des glaciers, des lacs, des villes et des villages offrent au public un aperçu du riche patrimoine archéologique du pays. Les étapes principales de l’histoire humaine sont ensuite présentées de manière chronologique, des premières traces de l’être humain il y a plus de 100 000 ans jusqu’à la diffusion et à la consolidation du christianisme vers 800 ans après Jésus-Christ. Différentes «poste de recherche» permettent enfin aux visiteurs de découvrir par eux-mêmes les interactions qui existent depuis des millénaires entre l’être humain et son environnement.